8ème édition de la journée de la plate-forme Bio-informatique Genouest Les techniques NGS (Next generation Sequencing)
Chaque année la plate-forme GenOuest organise une journée de rencontres autour d’un thème relié à la bio-informatique. Cette année, pour la 8ème édition de ces rencontres, le thème retenu était celui du Séquençage de Nouvelle Génération. Les interventions, mêlant biologie et bio-informatique, ont permises au public de découvrir les différents aspects des NGS d’un point de vue bio-informatique : projets dans le Grand Ouest, algorithmique, etc. L'ensemble des exposés ainsi que les échanges avec la salle ont été enregistrés. En voici les vidéos.
Les exposés scientifiques

8ème édition de la journée de la plate-forme Bio-informatique Genouest

Les techniques NGS (Next generation Sequencing)

Chaque année la plate-forme GenOuest organise une journée de rencontres autour d’un thème relié à la bio-informatique. Cette année, pour la 8ème édition de ces rencontres, le thème retenu était celui du Séquençage de Nouvelle Génération. Les interventions, mêlant biologie et bio-informatique, ont permises au public de découvrir les différents aspects des NGS d’un point de vue bio-informatique : projets dans le Grand Ouest, algorithmique, etc. L'ensemble des exposés ainsi que les échanges avec la salle ont été enregistrés. En voici les vidéos.

Les exposés scientifiques

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Olivier Collin (CNRS Rennes) - Les actualités de la plate-forme [16:25 ]	Yann Audic (CNRS Rennes) - Identification des cibles ARN de la protéine régulatrice CELF1 par LIP-soliD et RNAseq [ 52:32]
Les transparents (pdf)	Les transparents (pdf)
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Jean-Marc Aury (Genoscope / Centre National de Séquençage) - Les nouvelles technologies de séquençage au Genoscope : assemblage et annotation de génomes [57:43 ]	Pierre Peterlongo (INRIA Rennes) - Assemblage et mapping de données NGS : on en est où? Peut-on s’en passer? [34:08]
Les transparents	Les transparents (pdf)
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Matthias Zytnicki (INRA)- Méthodes et applications du RNA-Seq [ 47:28]	Philippe Vandenkoornhuyse (CAREN) - Génomique environnementale et NGS [ 42:36]
Les transparents ( à venir)	Les transparents ( à venir)
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Frédéric Mahé & Stéphane Audic - (Station Biologique de Roscoff) - The POSEIDON Project : Protistian diversity as revealed by Ribosomal Barcoding along the TARA OCEANS’ circumnavigation [53:14]	Fabrice Legeai - Traitement des séquences NGS chez les insectes ravageurs de culture [41:42]
Les transparents ( Présentation de Stéphane Audic - pdf))	Les transparents (pdf)
	Les précédentes rencontres Bio-informatiques
Edition page Web - Alain Crenn - REV-Com - 2010 - © I NRIA-Rennes-Bretagne Atlantique

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Olivier Collin (CNRS Rennes) - Les actualités de la plate-forme [16:25 ]

Yann Audic (CNRS Rennes) - Identification des cibles ARN de la protéine régulatrice CELF1 par LIP-soliD et RNAseq [ 52:32]

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Jean-Marc Aury (Genoscope / Centre National de Séquençage) - Les nouvelles technologies de séquençage au Genoscope : assemblage et annotation de génomes [57:43 ]

Pierre Peterlongo (INRIA Rennes) - Assemblage et mapping de données NGS : on en est où? Peut-on s’en passer? [34:08]

Les transparents

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Matthias Zytnicki (INRA)- Méthodes et applications du RNA-Seq [ 47:28]

Philippe Vandenkoornhuyse (CAREN) - Génomique environnementale et NGS [ 42:36]

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Frédéric Mahé & Stéphane Audic - (Station Biologique de Roscoff) - The POSEIDON Project : Protistian diversity as revealed by Ribosomal Barcoding along the TARA OCEANS’ circumnavigation [53:14]

Fabrice Legeai - Traitement des séquences NGS chez les insectes ravageurs de culture [41:42]

Les transparents ( Présentation de Stéphane Audic - pdf))

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