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Journée d'animation des axes Génomique et Bioinformatique

sur le thème du microbiome

espace conférences -14 décembre 2016

Centre Inria Rennes-Bretagne Atlantique

Les actualités des plate-formes Les 7 exposés

François Thomas (Station Biologique de Roscoff) ; Jérémie Bourdon (LINA/LS2N) ; Claire Lemaitre (Inria) ; Nathan Vannier (ECOBIO) ; Marie Chevallier (Irisa/ECOBIO) ; J.C. Simon & Cervin Guyomar (Inra et Inria) ; Thomas Carton (Biofortis)

img-OlivierCollinJSPlateformeBiogenouest2016 Actualité des plateformes des axes Bioinformatiques et Génomique - convergence entre les deux axes [19:55 mn]

par Olivier Collin, responsable de la plateforme Biogenouest ; Gildas Le Corguillé, responsable de la  plateforme bioinformatique ABIMS ; Audrey Bihouee, responsable de la plateforme Bioinformatique BIRD

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img-PhilippeVANDENKOORNHUYSEJSPlateformeBiogenouest2016 Présentation de l'axe génomique [13:12 mn]

par  Philippe VANDENKOORNHUYSE, coordinateur de la plateforme Génomique

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img-FrancoisThomasJourneePlateformeBiogenouest2016 Genetic Analysis of alginate utilization by the marine bacterium Zobellia galactanivorans
par François Thomas, Chargé de recherche CNRS à la Station Biologique de Roscoff [durée: 33:18 mn]

img-titreIndexPageWebJS2016 Les questions de la salle à François Thomas à 29:09 mn (cliquer sur l'onglet Chapitres) [durée: 4:09 mn]

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img-JeremieBourdonJourneePlateformeBioGenOuest2016 Communauté d’organismes : que savons-nous faire sur le méta-métabolisme ? [36:22 mn]

par Jérémie Bourdon, maître de conférence en informatique, rattaché au LINA/LS2N, dans l’équipe Combinatoire & Informatique, – Université de Nantes

img-titreIndexPageWebJS2016 Les questions de la salle à Jérémie Bourdon à 32:44 mn (cliquer sur l'onglet Chapitres) [durée: 3:38 mn]

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img-ClaireLemaitreJourneePlateformeBioGenOuest2016 Comparaison (massive) de (nombreux) métagénomes : passons par les kmers pour passer à l’échelle [35:45 mn]par Claire Lemaitre, chargée de recherche dans l’équipe Genscale au centre Inria Rennes

img-titreIndexPageWebJS2016 Les questions de la salle à Claire Lemaitre à 28:53 mn (cliquer sur l'onglet Chapitres) [durée: 6:51mn]

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img-NathanVannierJourneePlateformeBioGenOuest2016 L’héritabilité du microbiote des plantes [21:44 mn]

par Nathan Vannier, doctorant UMR CNRS 6553 ECOBIO, équipe Paysages, Changements Climatiques – Biodiversité

img-titreIndexPageWebJS2016 Les questions de la salle à Nathan Vannier à 18:40 mn (cliquer sur l'onglet Chapitres) [durée: 3:04 mn]

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img-MarieChevallierJourneePlateformeBioGenOuest2016 De la Biologie à l’Ecologie des Systèmes: comment gérer l’hétérogénéité des données et des outils ? [32:14 mn]

par Marie Chevallier, ingénieure CNRS Irisa/ECOBIO

img-titreIndexPageWebJS2016 Les questions de la salle à Marie Chevallier à 25:55 mn (cliquer sur l'onglet Chapitres) [durée: 6:17 mn]

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img-JCSimonJourneePlateformeBioGenOuest2016 img-CervinGuyomarJourneePlateformeBioGenOuest2016 APHID MICROBIOTA: FROM FIELD ECOLOGY TO METAGENOMICS

par Jean-Christophe Simon, chercheur au sein de l’équipe Ecologie et génétique des insectes, à l’IGEPP & Cervin Guyomar, doctorant au sein de l’équipe Irisa-Inria  Genscale

img-titreIndexPageWebJS2016 Les questions de la salle à Jean-Christophe Simon et à Cervin Guyomar à 27:54 mn (cliquer sur l'onglet Chapitres) [durée: 7:39 mn]

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img-ThomasCartonJourneePlateformeBioGenOuest2016 NGS & Microbiota case study in a private CRO

par Thomas Carton, Clinico-Microbiota Lab Manager au sein de BIOFORTIS

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Voir l'ensemble des manifestations scientifiques enregistrées depuis 2008 au centre de Rennes